分子动力学是 AI for Science 核心模拟方式，属于原子级计算。计算材料学是近年来飞速发展的一门新兴交叉学科，它涉及凝聚态物理学、材料物理学、理论化学、材料力学和工程力学、计算机算法等多个相关学科。其中分子动力学（Molecular Dynamics, MD）计算是最为核心模拟方法，主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动。分子动力学模拟将体系中每一个原子视为遵守牛顿第二定律的基本粒子，根据分子的势能函数得到作用在每一个原子上的力，在给定初始化条件和时间步长的前提下，利用牛顿第二定律求解运动方程便可得到原子在势能面上运动的轨迹。以分子动力学模拟计算的结果为基础可以进一步分析体系热力学性质及其他宏观性质。分子动力学模拟已成为 AI for Science研发中物理学、化学、材料科学及制药方面研究必不可少的工具，且常国用于模拟原子的扩散、相变、薄膜生长和表面缺陷等过程。
